Az Élelmiszertudományi Doktori Iskola (ÉDI) az 1993-ban akkreditált Élelmiszer-tudományi és Élelmiszer-mérnöki Doktori Program munkáját folytatja. A Doktori Iskola 2000-ben elnyerte az ideiglenes, 2002-ben pedig a végleges akkreditációt, amely feljogosítja az Élelmiszertudományi Kart az élelmiszertudományi és az élelmiszermérnöki diszciplinák területén tudományos képzési programok indítására és doktori fokozat adására.A Magyar Felsőoktatási Akkreditációs Bizottság 2007. április 27-i határozatára és 33/2007. (III.7.) kormányrendeletre – továbbá törzstagjelöltjei és saját adatközlésére – épülő megfelelőségi eljárás során a Doktori Iskola a "megfelel" minősítést kapta (MAB:2008/3/VIII/2/008. sz. határozat).
A Doktori Iskola célja, hogy biztosítsa a doktori (PhD) fokozat megszerzésének feltételeit a tehetséges és jól képzett élelmiszermérnökök, valamint az élelmiszer-tudományihoz kapcsolódó szakterületeken dolgozó diplomás szakemberek számára, akik vállalkoznak a tudományos munkára és a fokozatszerzésre az alábbi alprogramokhoz kapcsolódóan:
Alprogramok
A táplálkozási lánc élelmiszerkémiája és biokémiája (Felelős: dr. Fodor Péter)
Bioszervetlen vegyületek élettani szerepe és analitikája